数据集概述
本数据集基于美国东部两种温带树种全分布范围的根相关真菌群落分子分析,核心记录外生菌根真菌(EMF)丰富度随宿主分布中心到边缘距离的变化趋势,同时包含非菌根真菌群落及土壤真菌群落的对比数据,涉及7个结构化文件,用于揭示物种互作对植物分布边界的影响。
文件详解
- 元数据与汇总文件
- 文件名称:SampleMetadata_and_Summaries.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含样本基本信息及统计汇总,支撑样本背景与整体数据概览
- 群落矩阵文件(CSV格式,共5个)
- CommunityMatrixEMFLineage.csv:含sampleID、site、species、source等样本属性,及amanita、amphinema-tylospora等EMF谱系的丰度数据
- CommunityMatrixGenus.csv:以属分类层级记录真菌群落丰度矩阵
- CommunityMatrixOTUtranspose.csv:OTU(操作分类单元)水平的转置丰度矩阵
- CommunityMatrixSpecies.csv:以种分类层级记录真菌群落丰度矩阵
- allITS97cons102815labelsA.csv:含OTU编号及对应的真菌分类信息(从界到种的分类层级)
- 代表性序列文件
- 文件名称:rep_set.fna
- 文件格式:FNA
- 字段映射介绍:包含真菌ITS序列的代表性集合,用于分子分类与群落鉴定
数据来源
论文“Ectomycorrhizal fungal richness declines towards the host species' range edge”
适用场景
- 生物地理学研究:分析外生菌根真菌丰富度随宿主分布范围的梯度变化规律
- 植物-微生物互作研究:探讨菌根共生关系对植物分布边界的限制作用
- 真菌群落生态学分析:对比根际EMF、非菌根真菌及土壤真菌群落的分布差异
- 气候变化响应预测:评估边缘种群EMF群落退化对宿主树种气候适应能力的影响
- 分子生态学方法应用:基于ITS序列与OTU数据开展真菌群落分子鉴定与丰度分析