数据集概述
本数据集围绕蒽环类药物心脏毒性的遗传基础展开，通过诱导多能干细胞衍生心肌细胞的转录组分析，探究个体间药物反应差异与心脏毒性风险的关联，包含基因表达、剪接QTL等关键数据。
文件详解
- 数据文件（.gz格式压缩文件）：
- all_eqtl_w_ase.txt.gz：包含等位基因特异性表达信息的表达数量性状位点（eQTL）数据
- log2_counts_per_million.txt.gz：基因表达量的对数转换计数数据
- all_eqtl.txt.gz：全基因组表达数量性状位点数据
- all_splicing_qtl.txt.gz：剪接数量性状位点数据
- rarg_trans_eqtl.txt.gz：RARG基因座的转录组表达数量性状位点数据
- leafcutter_counts.txt.gz：Leafcutter工具分析的剪接事件计数数据
- 文本文件（.txt格式）：
- purity.txt：细胞系纯度数据，包含cell_line、dbgap、flow_date、purity字段
- annotation.txt：基因或样本注释信息
- leafcutter_samples.txt：Leafcutter分析的样本信息
- sample_table.txt：样本基本信息表
- 文档文件（.pdf格式）：
- embryoid_staining.pdf：胚胎干细胞染色相关的实验图片或报告
适用场景
- 药物基因组学研究：分析蒽环类药物心脏毒性的遗传调控机制
- 转录组学分析：探究药物暴露下基因表达与剪接的变化规律
- 个体化医疗研究：预测个体对蒽环类药物的心脏毒性风险
- 生物信息学方法验证：QTL定位与基因调控网络分析的方法学应用
- 毒理学机制研究：药物诱导心肌细胞损伤的分子机制解析
