数据集概述
本数据集包含论文“Entropy as a Design Principle in the Photosystem II Supercomplex”的相关数据与代码,共9个文件,涵盖光合系统II超复合体的结构分析、参数计算等内容,支持该研究的可重复性验证与拓展分析。
文件详解
- 代码文件(.m格式,共5个)
- 文件名称:Calc_TurnPoints.m、Calc_DrivingForces.m、Calc_ProtIdxs.m、Calc_RC_Distance.m、Calc_QuantumYield.m
- 文件格式:.m
- 内容说明:用于计算光合系统II超复合体的关键参数,包括转折点、驱动力、蛋白索引、反应中心距离、量子产率等
- 数据文件(.xlsx格式,共3个)
- 文件名称:MasterDomainList_5XNL_v3.xlsx、Site_to_Exciton_C2S2M2.xlsx、5XNL_v3_Mg_Position.xlsx
- 文件格式:.xlsx
- 内容说明:包含5XNL结构域列表、位点与激子映射关系、镁离子位置等数据
- 科学数据文件(.mat格式,共1个)
- 文件名称:C2S2M2_300K_RateMtx_RP1.mat
- 文件格式:.mat
- 内容说明:存储300K下C2S2M2复合体的速率矩阵数据
数据来源
论文“Entropy as a Design Principle in the Photosystem II Supercomplex”
适用场景
- 光合系统结构研究: 分析Photosystem II超复合体的结构设计与熵原理的关系
- 生物物理参数计算: 利用代码文件复现或拓展光合系统关键参数的计算
- 结构生物学数据分析: 基于镁离子位置、结构域列表等数据开展光合系统结构解析
- 量子产率与反应动力学研究: 通过速率矩阵与量子产率计算文件,探究光合系统的能量传递机制