数据集概述
本数据集围绕环境富集对红树林鳉鱼(Kryptolebias marmoratus)的跨代行为与表观遗传影响展开研究,包含亲代环境对后代表型的作用机制相关数据。研究涉及亲代行为、代谢率、脑DNA甲基化模式及后代行为特征的关联分析,共包含4个文件,核心数据为Excel格式,用于支持鱼类表观遗传与跨代效应的科学研究。
文件详解
- 差异甲基化分析文件:
- 文件名称:DifferentialMethylation_MethylKit
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:推测包含亲代差异甲基化胞嘧啶(DMCs)相关数据,涉及1854个甲基化位点的鉴定结果
- 甲基化位点注释文件:
- 文件名称:1854_dmcs_annotation.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含1854个差异甲基化胞嘧啶的注释信息,可能涉及基因功能、位点位置等关联数据
- 行为与生理整合数据文件:
- 文件名称:Integrated_data_BehaviourandPhysiology.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:整合亲代与后代的行为学数据(如活动性、新环境恐惧症)及生理学指标(如皮质醇水平、代谢率)
- 甲基化评分与分类文件:
- 文件名称:MethylationScoresandClassification.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含甲基化评分数据及基于机器学习分类方法的分析结果,关联甲基化模式与表型特征
数据来源
论文“Environmental enrichment induces intergenerational behavioural and epigenetic effects on fish”
适用场景
- 鱼类表观遗传学研究:分析环境富集对红树林鳉鱼脑DNA甲基化模式的影响及跨代传递机制
- 跨代行为效应分析:探究亲代环境富集对后代活动性、新环境恐惧症等行为特征的调控作用
- 生理与表观遗传关联研究:关联皮质醇水平、代谢率等生理指标与差异甲基化位点的对应关系
- 机器学习分类应用:基于甲基化评分数据开展鱼类表型特征的分类模型构建与验证