数据集概述
本数据集包含与Nature论文相关的Cytoscape文件,涉及通路富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)映射。通过epichaperomics技术分析癌症细胞PPI网络失调,揭示癌症特异性应激适应机制,为癌症治疗策略提供系统生物学层面的依据。
文件详解
- 文件名称:README-CYTOSCAPE.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含Cytoscape文件的说明文档,可能涉及数据背景、使用方法、文件内容概述等信息。
- 文件名称:Cytoscape Fig7a.cys
- 文件格式:CYS
- 字段映射介绍:对应论文图7a的Cytoscape网络文件,包含PPI网络结构及相关通路富集分析数据。
- 文件名称:Cytoscape Fig7c SFig7b.cys
- 文件格式:CYS
- 字段映射介绍:对应论文图7c和补充图7b的Cytoscape网络文件,包含PPI网络及通路分析数据。
- 文件名称:Cytoscape SFigs5-6.cys
- 文件格式:CYS
- 字段映射介绍:对应论文补充图5-6的Cytoscape网络文件,包含PPI网络及通路分析数据。
- 文件名称:Reactome_YK_A_AB_ABC_Fig7b.cys
- 文件格式:CYS
- 字段映射介绍:对应论文图7b的Reactome通路分析Cytoscape文件,包含通路富集结果及PPI网络数据。
- 文件名称:Cytoscape Fig7d.cys
- 文件格式:CYS
- 字段映射介绍:对应论文图7d的Cytoscape网络文件,包含PPI网络结构及相关分析数据。
数据来源
论文“Systems-level analyses of protein-protein interaction network dysfunctions via epichaperomics identify cancer-specific mechanisms of stress adaptation”(Nature Communications,https://www.nature.com/articles/s41467-023-39241-7)
适用场景
- 癌症PPI网络失调机制研究:分析癌症细胞中蛋白质相互作用网络的异常变化,揭示应激适应的分子机制。
- 通路富集分析:利用Cytoscape文件中的通路数据,研究癌症相关信号通路的激活或抑制状态。
- 癌症治疗靶点发现:基于epichaperome相关PPI网络,识别潜在的癌症治疗靶点。
- 系统生物学研究:从系统层面解析癌症细胞的蛋白质网络调控机制,为精准医疗提供数据支持。