EST_SSR_IUCN_Based_濒危植物分子标记数据库_存档

数据集概述

本数据集是基于NCBI公共EST数据库开发的濒危植物EST-SSR标记资源,涵盖IUCN红色名录257个属的14498726条EST序列,识别出17102个可直接测试的EST-SSR标记,涉及193个植物属。数据支持濒危植物的遗传多样性研究、种群遗传学分析及跨物种标记转移应用。

文件详解

  • 文件名称:README_for_Type I EST_SSR.7z
  • 文件格式:7Z
  • 字段映射介绍:包含数据集的说明文档,可能涉及EST-SSR标记的开发方法、数据来源、使用指南及标记信息的注释说明。
  • 文件名称:Type I EST_SSR.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含核心数据文件,推测为193个濒危植物属的17102个EST-SSR标记序列、引物信息及相关分类统计数据,支持直接用于分子实验测试。

数据来源

NCBI GenBank数据库(dbEST子库)、IUCN红色名录

适用场景

  • 濒危植物遗传多样性研究: 利用EST-SSR标记分析濒危物种的种群遗传结构与多样性水平。
  • 植物保护遗传学分析: 评估濒危植物的遗传分化、基因流及濒危机制,为保护策略制定提供数据支持。
  • 跨物种标记转移应用: 基于标记的跨属扩增成功率,拓展至更多近缘濒危物种的遗传研究。
  • 分子标记开发参考: 为非模式濒危植物的SSR标记开发提供低成本、高效的方法参考。
  • 植物进化研究: 利用编码区相关的三核苷酸重复标记,探究濒危植物的进化关系与适应性演化。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 28.47 MiB
最后更新 2026年1月27日
创建于 2026年1月27日
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