数据集概述
本数据集基于黑腹果蝇实验室种群实验，探究微卫星标记与系谱法计算的近交系数、亲缘关系系数的相关性，分析遗传多样性降低对计算准确性的影响，包含实验数据、模拟代码及结果文件，共31个文件。
文件详解
- 说明文档类（TXT格式）
- 文件名称：list of file names and descriptions.txt、各README_for_file系列文件
- 内容：文件清单及描述、各数据/代码文件的说明文档
- 数据文件类
- 文件名称：file 3 - x5 data for MasterBayes.txt、file 5 - x1 data for MasterBayes null alleles removed.txt、file 17 - x0 data for MasterBayes cr3 only.txt等
- 文件格式：TXT
- 字段映射：包含样本ID（如AC_1_MP_C1_1_C_2）、微卫星位点（如90a、90b）及对应等位基因数据
- 文件名称：Microsatellite list.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容：微卫星位点清单
- 代码文件类（R格式）
- 文件名称：file 8 - R code for simulations based on allele frequencies in experimental populations.R、file 9 - R code for simulations based on allele frequencies in experimental populations (linkage taken into account).R、file 14 - R code for simulations with null alleles introduced to all loci with frequency.R等
- 内容：实验种群等位基因频率模拟代码、连锁效应模拟代码、无效等位基因模拟代码
数据来源
论文“Estimating relatedness and inbreeding using molecular markers and pedigrees: the effect of demographic history”
适用场景
- 遗传学研究: 分析分子标记与系谱法计算近交系数、亲缘关系系数的相关性
- 种群遗传学: 探究瓶颈效应等种群历史对遗传多样性及相关系数计算的影响
- 分子标记应用评估: 验证微卫星标记在低遗传多样性种群中的准确性
- 生物信息学模拟: 利用R代码进行等位基因频率、连锁效应、无效等位基因的模拟分析
