数据集概述
本数据集通过DArTseq基因组方法，分析澳大利亚东南部Eucalyptus microcarpa（Grey Box）的基因组多样性模式，涵盖大型残遗林、小型隔离残遗林及植被恢复地的样本，对比不同林分类型的基因组多样性与分化特征，为植被恢复的遗传多样性评估提供依据。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、实验设计、数据处理流程及文件使用说明等内容
- Emicrocarpa_metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：样本元数据文件，记录样本来源（残遗林、植被恢复地等）、地理位置、采样信息等基础属性
- population-filter.vcf.gz
- 文件格式：VCF.GZ
- 字段映射介绍：群体水平过滤后的基因组变异数据文件，包含单核苷酸多态性（SNP）位点信息、群体基因型数据及质量控制指标
- global-filter.vcf.gz
- 文件格式：VCF.GZ
- 字段映射介绍：全基因组水平过滤后的基因组变异数据文件，包含更全面的SNP位点及基因型信息，覆盖研究区域内所有样本的基因组变异特征
数据来源
论文“Landscape genomics reveals altered genome wide diversity within revegetated stands of Eucalyptus microcarpa (Grey Box)”
适用场景
- 植被恢复遗传评估: 分析植被恢复地与自然残遗林的基因组多样性差异，评估恢复措施对遗传多样性的保护效果
- 景观基因组学研究: 探究Eucalyptus microcarpa在碎片化景观中的基因组分化模式及染色体水平的多样性变化
- 林木遗传资源管理: 为澳大利亚东南部Eucalyptus microcarpa的遗传资源保护及恢复策略制定提供基因组学依据
- 基因组变异分析: 利用VCF文件中的SNP数据，开展群体遗传结构、基因流及适应性进化相关研究
