数据集概述
本数据集聚焦Ozark高原洞穴蝾螈（Eurycea spelaea complex）的系统发育基因组模式，探究该物种因栖息地特化导致的扩散限制与异域物种形成机制。通过线粒体DNA（mtDNA）和多基因座核DNA（nucDNA，基于锚定杂交富集技术）重建种群级系统发育树，分析遗传变异与地理特征的关联，揭示Ozark高原地质水文历史对其谱系分化的影响。
文件详解
- 文件名称：Phillips et al. 2017, J Biogeogr; 251 alignments of nuclear loci.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包包含251个核基因座的比对文件，涉及线粒体DNA（mtDNA）和多基因座核DNA（nucDNA）数据，用于重建洞穴蝾螈的种群级系统发育树，分析遗传距离与地理特征（古水系、现代水系、亚高原）的关联。
数据来源
论文“Hydrologic and geologic history of the Ozark Plateau drive phylogenomic patterns in a cave-obligate salamander”（Phillips et al. 2017, J Biogeogr）
适用场景
- 生物地理学研究：分析洞穴蝾螈的谱系分化与Ozark高原地质水文历史的关联，探究栖息地特化对物种形成的影响。
- 种群遗传学分析：利用线粒体和核基因数据，研究洞穴蝾螈种群的遗传结构、基因流模式及隔离机制。
- 系统发育重建：基于锚定杂交富集技术获取的核基因座数据，构建洞穴蝾螈的种群级系统发育树。
- 地理特征与遗传变异关联研究：验证古水系、现代水系及亚高原等地理特征对洞穴蝾螈遗传变异的解释力。
