数据集概述
本数据集聚焦马肠道微生物组,对比分析了未驯化的普氏野马与放牧家养马的粪便微生物组差异,同时研究了圈养对普氏野马微生物多样性的影响。包含饮食矩阵、分类学信息及补充表格,可用于探究人为因素对哺乳动物肠道微生物的重塑作用,总计五个文件。
文件详解
- 说明文档(README文件)
- 文件名称:README_for_Diet.Matrix-final.txt、README_for_Diet.Matrix.taxonomy.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供数据处理方法、引用文献及元数据说明,提及trnL数据由Laboratoire d’Ecologie Alpine(LECA)等机构生成,用于下游分析参考。
- 饮食矩阵数据文件
- 文件名称:Diet.Matrix-final.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:基于16S rRNA测序DNA提取物生成的粪便植物相关数据文件,具体字段未完全披露,推测包含样本饮食相关微生物或植物标记物信息。
- 分类学数据文件
- 文件名称:Diet.Matrix.taxonomy.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含OTUID(操作分类单元ID)、taxonomy1至taxonomy4(多级分类学信息)、sequence(序列)等字段,记录微生物分类学注释及对应序列信息。
- 补充表格文件
- 文件名称:TableS3_CORRECTED_2018.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测为研究中的补充表格数据,具体内容未完全披露,可能包含样本元数据、统计结果或详细实验数据。
数据来源
论文“Evaluating the impact of domestication and captivity on the horse gut microbiome”
适用场景
- 微生物生态学研究: 分析驯化与圈养对马肠道微生物群落结构及多样性的影响机制。
- 比较微生物组学分析: 对比普氏野马与家养马肠道微生物组差异,探究宿主生活方式与微生物组的关联。
- 保护生物学应用: 为濒危哺乳动物(如普氏野马)的保护管理提供肠道微生物组层面的参考依据。
- 饮食与微生物互作研究: 结合饮食矩阵数据,探究马饮食结构对肠道微生物组成的调控作用。