Evaluating_Mammal_Gut_Microbiome_马肠道微生物组驯化与圈养影响评估数据

数据集概述

本数据集聚焦马肠道微生物组,对比分析了未驯化的普氏野马与放牧家养马的粪便微生物组差异,同时研究了圈养对普氏野马微生物多样性的影响。包含饮食矩阵、分类学信息及补充表格,可用于探究人为因素对哺乳动物肠道微生物的重塑作用,总计五个文件。

文件详解

  • 说明文档(README文件)
  • 文件名称:README_for_Diet.Matrix-final.txt、README_for_Diet.Matrix.taxonomy.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:提供数据处理方法、引用文献及元数据说明,提及trnL数据由Laboratoire d’Ecologie Alpine(LECA)等机构生成,用于下游分析参考。
  • 饮食矩阵数据文件
  • 文件名称:Diet.Matrix-final.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:基于16S rRNA测序DNA提取物生成的粪便植物相关数据文件,具体字段未完全披露,推测包含样本饮食相关微生物或植物标记物信息。
  • 分类学数据文件
  • 文件名称:Diet.Matrix.taxonomy.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含OTUID(操作分类单元ID)、taxonomy1至taxonomy4(多级分类学信息)、sequence(序列)等字段,记录微生物分类学注释及对应序列信息。
  • 补充表格文件
  • 文件名称:TableS3_CORRECTED_2018.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:推测为研究中的补充表格数据,具体内容未完全披露,可能包含样本元数据、统计结果或详细实验数据。

数据来源

论文“Evaluating the impact of domestication and captivity on the horse gut microbiome”

适用场景

  • 微生物生态学研究: 分析驯化与圈养对马肠道微生物群落结构及多样性的影响机制。
  • 比较微生物组学分析: 对比普氏野马与家养马肠道微生物组差异,探究宿主生活方式与微生物组的关联。
  • 保护生物学应用: 为濒危哺乳动物(如普氏野马)的保护管理提供肠道微生物组层面的参考依据。
  • 饮食与微生物互作研究: 结合饮食矩阵数据,探究马饮食结构对肠道微生物组成的调控作用。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 12.97 MiB
最后更新 2026年1月2日
创建于 2026年1月2日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。