数据集概述
本数据集是“Expanding the chicken gut virome: Uncovering viral diversity, host interactions, and regional variations across the intestinal tract”研究的补充文件,包含四份文件,涵盖鸡宏基因组数据及样本信息、病毒基因组质量评估、CGVD分类与宿主预测、病毒功能及遗传分析等内容,为鸡肠道病毒组研究提供结构化支撑。
文件详解
- Additional file 1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Tables S1(鸡宏基因组数据详情)、Tables S2(鸡肠道不同区域样本信息)
- Additional file 2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Tables S3(聚类前中高质量vOTUs质量评估)、Tables S4(CGVD中病毒质量评估)
- Additional file 3.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Tables S5(CGVD科级物种注释信息)、Tables S6(CGVD门级及科级宿主预测信息)、Tables S7(CGVD生活方式预测结果)
- Additional file 4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Tables S8(辅助代谢基因详情)、Tables S9(CAZyme数据库注释结果)、Tables S10(耐药基因注释结果)、Tables S11(可移动遗传元件注释结果)、Tables S12(毒力因子注释结果)
数据来源
论文“Expanding the chicken gut virome: Uncovering viral diversity, host interactions, and regional variations across the intestinal tract”
适用场景
- 鸡肠道病毒组多样性研究:分析不同肠道区域病毒组成及区域差异特征
- 病毒基因组质量评估:支撑病毒操作分类单元(vOTUs)及鸡肠道病毒数据库(CGVD)的质量验证
- 病毒分类与宿主互作分析:基于CGVD的分类注释、宿主预测及生活方式数据,探究病毒-宿主关系
- 病毒功能基因组学研究:利用辅助代谢基因、毒力因子等注释结果,解析鸡肠道病毒的功能及遗传特征
- 农业动物微生物组应用:为鸡肠道健康管理及病毒性疾病防控提供数据参考