数据集概述
本数据集包含肺炎链球菌细胞周期中肽聚糖组装纳米尺度动力学的相关图像与模型文件,涵盖不同实验条件下的显微镜图像、蛋白质分析图像、3D模型、测量数据及动态视频,为研究肺炎链球菌肽聚糖合成机制提供多类型数据支持。
文件详解
该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下:
- 显微镜图像文件(.tif、.jpg格式):
- 原始相差图像:用于分析aDA-DA存在下肺炎链球菌细胞形态
- 相差与衍射极限图像:用于确定aDA-DA标记浓度及D-环丝氨酸对aDA/aDA-DA掺入的影响
- 明场、衍射极限与dSTORM图像:用于确定aDA-DA孵育时长及分析肽聚糖合成
- 示例文件:20190705-D39-zDADA-AF647-PULSE-CHASE-inCY-Acq2-Conv.tif、20190906-D39-zDADA-AF647-PULSE-MicroHolesPad-Acq9-RenderNormGauss-SigCor.jpg等
- 蛋白质分析图像(.tif、.jpg格式):
- 原始Western blot图像:用于分析肺炎链球菌中PBP2b的消耗水平
- 3D模型与测量数据文件:
- 3D Spneu cell wall animated model ArtOfIllusion.aoi:肺炎链球菌细胞壁3D动画模型
- 3D Spneu cell wall geometrical model Excel.xlsx:肺炎链球菌细胞壁几何模型Excel文件
- Trouve_All_dSTORM_measures.xlsx:dSTORM测量数据汇总表
- 动态视频文件(.mp4格式):
- MovieS1_morpho_pneumo_pulse.mp4:肺炎链球菌脉冲标记形态学视频
- MovieS2_morpho_pneumo_pulse-chase.mp4:肺炎链球菌脉冲追踪形态学视频
适用场景
- 微生物学研究:分析肺炎链球菌肽聚糖组装的纳米尺度动力学机制
- 细胞生物学研究:探究肺炎链球菌细胞周期中肽聚糖合成的时空特征
- 药物研发应用:评估D-环丝氨酸等药物对肺炎链球菌肽聚糖合成的影响
- 生物模型构建:基于3D模型与测量数据建立肺炎链球菌细胞壁结构模型