数据集概述
本数据集为《非洲栽培稻不同种群光合性状自然变异》研究的补充数据与图表,包含描述性统计、相关性分析、聚类结果、可视化报告及方法文档等,支持对非洲栽培稻光合相关表型特征及其与环境因素关系的深入分析。
文件详解
- 描述性统计文件:
- Supp. data FileS2_Glab_DescriptiveStats.csv:CSV格式,含非洲栽培稻光合性状的统计指标(最小值、最大值、中位数、标准差等)
- Supp. data FileS3_IR64_DescriptiveStats.csv:CSV格式,含对照品种IR64的表型统计数据
- 相关性分析文件:
- Supp. dataFileS10_CorrelationTable_PhenoTraits.csv:CSV格式,表型性状间相关性表
- Supp. dataFileS12_CorrelationTable_ClimatePhenoPcs_105Accessions.csv:CSV格式,气候因子与表型主成分的相关性表
- 聚类分析文件:
- Supp. dataFileS11_Accessions_in_each_HClust_clade.xlsx:Excel格式,各层次聚类分支包含的材料编号
- 可视化报告文件:
- Supp. data FileS4_O.glabO.sativa_BoxDensityPlots.pdf:PDF格式,非洲栽培稻与亚洲栽培稻表型分布箱线图与密度图
- Supp. dataFileS6_FactoShiny_PhenotypePCA_Report.pdf:PDF格式,表型主成分分析报告
- Supp. dataFileS7_FactoShiny_PhenotypeHClust_Report.pdf:PDF格式,表型层次聚类分析报告
- 方法与代码文件:
- Supp. data FileS1_StomataCounting_Method.pdf:PDF格式,气孔计数方法说明
- Supp. data FileS5_python curve extraction code.pdf:PDF格式,曲线提取Python代码
- 补充文档与图表:
- List of Supplementary data files.docx:Word格式,补充数据文件清单
- Supplementary Figures 1-8.pptx:PPT格式,补充图表1-8
适用场景
- 作物生理学研究:分析非洲栽培稻光合性状的遗传变异特征
- 环境适应性研究:探究气候因子对稻属植物表型的影响机制
- 作物育种应用:挖掘高光效相关的优异等位基因资源
- 生物统计学方法验证:测试表型数据的聚类分析与主成分分析流程