数据集概述
该数据集包含芬兰Åland群岛15个车前草白粉菌(Podosphaera plantaginis)种群的流行病学与遗传数据,记录单季流行病时空进展及菌株采样信息,用于分析菌株组成、多样性、适合度及空间分布与流行病动态的关联。
文件详解
- 文档文件:
- README.pdf: PDF格式,可能包含数据集背景、实验方法、文件说明等补充信息
- 文本数据文件(.txt格式):
- DEMfinal.txt: 包含种群(pop)、样点(circle)、经纬度(long/lat)、日期(date)、感染车前草面积(area.plantago.inf)等流行病学时空数据字段
- GENfinal.txt: 可能包含菌株遗传信息数据
- for_making_fig_3c_-_initial_vs_final_strain_abundance_in_each_pop.txt: 各种群初始与最终菌株丰度数据,用于生成图表
- 15_pops_B2_-per_MLG_sample(long)_-_coinfs_resolved.txt: 15个种群中每个多位点基因型(MLG)样本的菌株共感染解析数据(长格式)
- 15_pops_C2_-per_circle_per_time_point(long)_-_to_upload.txt: 每个样点每个时间点的长格式数据
- MLG_community_matrix_-by_pop-coinfections_resolved-_cumulative.txt: 按种群划分的MLG群落矩阵(共感染解析,累积数据)
- demographic_data_for_StrainRanking.txt: 菌株排名相关的种群统计数据
- MLG_freq_by_pop_by_date_coinfections_resolved.txt: 按种群和日期划分的MLG频率数据(共感染解析)
适用场景
- 植物病理学研究: 分析白粉菌菌株组成、多样性对流行病动态的影响
- 微生物生态学研究: 探究病原菌空间分布模式与种群适合度的关联机制
- 流行病学建模: 为病原菌传播模型提供菌株水平的实证数据支持
- 进化生物学研究: 研究病原菌菌株时空动态及适合度差异的进化驱动因素