数据集概述
本数据集为Bernhard F. Roeck等人发表于《Nature Communications》的铁死亡研究相关脂质组学数据,包含26个文件,以LC-MS/MS技术分析铁死亡诱导后细胞的脂质变化,核心探究铁死亡通过细胞膜接触向邻近细胞传播的机制,支持铁死亡相关病理过程的研究。
文件详解
- 元数据文件(Metadata)
- 文件名称:Metadata_462513_OxGPLs_HeLas_Ansatz 1_Fig 1G.xlsx、Metadata_462516_fatty acids_HeLas_Fig 1H.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:对应研究图表1G(氧化甘油磷脂数据)和1H(脂肪酸数据)的元数据,记录实验设计、样本信息与结果关联
- 质谱原始数据文件(mzML)
- 文件名称:遵循两种命名模式:
Ansatz1_462513_OxGPLs_S[编号]_sample_a_cells_HeLa_[时间]min_Opto-[组别]_[颜色].mzML(如Ansatz1_462513_OxGPLs_S10_sample_a_cells_HeLa_60min_Opto-GPX4Deg_blue.mzML)
462516_fatty acids_S[编号]_sample_a_cells_HeLa_[时间]min_Opto-[组别]_[颜色].mzML(如462516_fatty acids_S07_sample_a_cells_HeLa_0min_Opto-GPX4Deg_blue.mzML)
- 文件格式:mzML
- 字段映射介绍:记录LC-MS/MS检测的原始质谱数据,包含氧化甘油磷脂(OxGPLs)和脂肪酸的定量信息,样本涵盖不同处理组(Opto-GPX4Deg诱导组、Opto-Ctrl对照组)、不同时间点(0min、60min)及不同光照条件(blue、green)
数据来源
论文“Ferroptosis spreads to neighboring cells via plasma membrane contacts”(Ana J. Garcia-Saez实验室,待发表于Nature Communications)
适用场景
- 铁死亡机制研究: 分析脂质过氧化在细胞间传播的理化机制,验证GPX4降解诱导的铁死亡扩散规律
- 细胞死亡病理研究: 探究邻近细胞膜接触对坏死组织扩散的影响,为疾病相关组织坏死机制提供数据支持
- 脂质组学分析: 利用氧化甘油磷脂、脂肪酸的质谱数据,研究铁死亡过程中的脂质代谢变化
- 细胞间信号传递研究: 结合细胞接触条件与脂质变化数据,解析铁死亡信号在细胞间的传递路径