数据集概述
本数据集包含黏菌Didymium和Physarum物种多宿主培养研究的原始数据及R分析脚本,覆盖孢子萌发、原生质体纯化、生长动态、菌核活力和子实体生产等实验内容,支持研究结果的透明化与可重复性验证。
文件详解
- 数据文件(Excel数据集)
- 文件名称:遵循编号+语义命名模式(如01_Data_Isolate_selection_germination_strength_pivot_longer.xlsx、02_Data_Germination_rates_before_after_freezing.xlsx等共6个文件)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含菌株筛选、孢子萌发率、原生质体纯化、生长模型、菌核活力、子实体孢子萌发等实验的原始数据,各文件对应不同实验环节,具体变量、单位及使用背景见各文件内置README表(描述提及)。
- 分析脚本(R脚本)
- 文件名称:遵循编号+语义命名模式(如01_R_Isolate_Selection_V3_27082025.R、03_R_Germination_rates__before_after_V6.2_19082025.R等共7个文件)
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:包含GLMM、LMM、Kruskal–Wallis、Dunn’s检验等统计分析及图表生成代码,对应数据表与论文图表/表格(如菌株筛选对应表1-2、补充图1,萌发率对应图1等),脚本全注释。
数据来源
论文“Defined polyxenic cultivation of Didymium and Physarum species for small-scale laboratory production of plasmodia, sclerotia and sporocarps”(待提交至Mycologia)
适用场景
- 黏菌培养技术优化: 分析多宿主培养条件下孢子萌发、原生质体纯化的关键参数,优化培养方案。
- 黏菌生长动力学研究: 利用生长模型数据与R脚本,探究不同条件下黏菌生长动态规律。
- 微生物实验可重复性验证: 通过原始数据与分析脚本,复现黏菌培养实验的统计分析结果。
- 黏菌繁殖机制研究: 分析菌核活力与子实体生产数据,探究黏菌繁殖相关生理过程。
- 微生物学统计方法应用: 参考R脚本中的GLMM、非参数检验等方法,应用于同类微生物实验数据分析。