数据集概述
本数据集围绕榕树(Ficus)与传粉榕小蜂(Agaonidae)的专性传粉共生关系展开,通过分子标记分析中国南部及台湾-琉球群岛6种近缘雌雄异株榕树及其传粉者的系统发育关系与种群遗传结构,探究宿主转移导致的传粉者物种形成机制,揭示传粉者共享、协同传粉等现象,为专性传粉共生系统的物种形成与宿主特异性研究提供数据支持。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:Data_information_220107.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集信息说明文档,可能包含研究背景、实验设计、数据采集与分析方法等内容
- 表格类文件
- 文件名称:Blastophaga_SSR_190405.xlsx、Ferecta_complex_SSR_190411.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:传粉榕小蜂(Blastophaga)及榕树复合体(Ferecta complex)的SSR分子标记数据,包含基因型、等位基因频率等种群遗传信息
- 序列比对文件(.fas格式)
- 文件名称:Blastophaga_28S_haplo_901_9_aln.fas、Blastophaga_ITS1_1712_56_aln.fas、Blastophaga_COI-COII_2053_205_aln.fas等8个文件
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:传粉榕小蜂的28S rRNA、ITS1、COI-COII等基因片段的序列比对数据,包含不同个体的核苷酸序列及比对结果,用于系统发育分析
- 系统发育树文件
- 文件名称:Figwasp_calibration_Com_species_annotated_trees.nexus
- 文件格式:NEXUS
- 字段映射介绍:带有校准信息的传粉榕小蜂物种注释系统发育树数据,包含物种分类、分化时间校准点等信息
数据来源
论文“Pollinator sharing, copollination, and speciation by host shifting among six closely related dioecious fig species”
适用场景
- 传粉共生系统物种形成机制研究:分析宿主转移导致传粉者物种形成的过程与关键因素
- 种群遗传结构分析:利用SSR、SNP等分子标记数据探究榕树及传粉者的种群分化与基因流
- 系统发育关系重建:基于多基因序列比对数据构建榕树与传粉者的系统发育树,揭示亲缘关系
- 宿主特异性进化研究:结合传粉者共享、协同传粉现象,探讨专性传粉共生系统中宿主特异性的维持与进化机制