数据集概述
本数据集为Filistatidae蜘蛛科系统发育与生物地理学研究的补充材料，包含表型特征矩阵、DNA序列比对、系统发育分析输入文件、共识树结果、生物地理学模型数据等27份文件，支持长距离扩散与大陆漂移相关的生物地理学假说验证，覆盖表型、序列、总证据等多维度分析场景。
文件详解
- 表型特征数据
- 文件名称：S1-SUP-PHENOTYPIC-MATRIX.ss
- 文件格式：.ss
- 字段映射介绍：表型特征矩阵，用于表型数据的系统发育分析
- DNA序列比对数据
- 文件名称：S2-SUP-FASTA-COI.fas、S3-SUP-FASTA-H3.fas、S4-SUP-FASTA-16S.fas、S5-SUP-FASTA-28S.fas
- 文件格式：.fas
- 字段映射介绍：COI、H3、16S、28S基因序列的比对结果，支持序列数据的系统发育分析
- 系统发育分析输入文件
- 文件名称：S6-SUPMAT-PHENOTYPIC-TNT.tnt（表型数据TNT简约分析输入）、S7-SUPMAT-PHENOTYPIC-MRBAYES.nex（表型数据MrBayes贝叶斯分析输入）、S8-SUPMAT-DNA-TNT.tnt（序列数据TNT简约分析输入）、S9-SUPMAT-DNA-MRBAYES.nex（序列数据MrBayes贝叶斯分析输入）、S10-SUPMAT-TE-TNT.tnt（总证据TNT简约分析输入）、S11-SUPMAT-TE-MRBAYES.nex（总证据MrBayes贝叶斯分析输入）、S12-SUPMAT-RED-TE-TNT.tnt（简化终端总证据TNT简约分析输入）、S13-SUPMAT-RED-TE-MRBAYES.nex（简化终端总证据MrBayes贝叶斯分析输入）、S14-SUPMAT-TIPDATING.nex（总证据 tip-dating 贝叶斯分析输入）、S15-SUPMAT-NODEDATING.xml（序列数据 node-dating 贝叶斯分析输入）
- 文件格式：.tnt、.nex、.xml
- 字段映射介绍：不同分析方法（简约法、贝叶斯法）、不同数据类型（表型、序列、总证据）的系统发育分析参数与输入配置
- 系统发育树结果文件
- 文件名称：S18-SUPTREE-PHENO-TNT.tre（表型数据TNT简约分析共识树）、S19-SUPTREE-PHENO-MRBAYES.tre（表型数据MrBayes贝叶斯分析共识树）、S20-SUPTREE-DNA-TNT.tre（序列数据TNT简约分析共识树）、S21-SUPTREE-DNA-MRBAYES.tre（序列数据MrBayes贝叶斯分析共识树）、S22-SUPTREE-TE-TNT.tre（总证据TNT简约分析共识树）、S23-SUPTREE-TE-MRBAYES.tre（总证据MrBayes贝叶斯分析共识树）、S24-SUPTREE-RED-TE-TNT.tre（简化终端总证据TNT简约分析共识树）、S25-SUPTREE-RED-TE-BAYES.tre（简化终端总证据MrBayes贝叶斯分析共识树）、S26-SUPTREE-TIPDATING.tre（总证据 tip-dating 贝叶斯分析共识树）、S27-SUPTREE-NODEDATING.tre（序列数据 node-dating 贝叶斯分析最大分支可信度树）
- 文件格式：.tre
- 字段映射介绍：不同分析场景下的系统发育树结构，包含分支关系与节点信息
- 生物地理学分析数据
- 文件名称：S16-SUPMAT-DISTANCES-PROBABILITIES.xlsx、S17-SUPMAT-BIOGEOBEARS.zip
- 文件格式：.xlsx、.zip
- 字段映射介绍：包含不同时间切片的地理距离、扩散概率矩阵，以及生物地理学模型（如BioGeoBEARS）的输入文件，支持祖先分布区估计与生物地理随机映射分析
数据来源
论文“Phylogeny and biogeography of the ancient spider family Filistatidae (Araneae) is consistent both with long-distance dispersal and vicariance following continental drift”
适用场景
- 蜘蛛科系统发育研究：利用表型矩阵与DNA序列比对数据，重建Filistatidae科的演化关系
- 生物地理学假说验证：通过地理距离矩阵与扩散概率数据，分析长距离扩散与大陆漂移相关的生物地理过程
- 系统发育分析方法比较：对比TNT简约法与MrBayes贝叶斯法在不同数据类型（表型、序列、总证据）下的分析结果差异
- 节点年代估计研究：利用tip-dating与node-dating输入文件，探究Filistatidae科的演化时间尺度
- 生物信息学方法应用：作为生物地理学模型（如BioGeoBEARS）的输入案例，支持相关分析工具的测试与验证
