Fish_Tree_of_Life_Bony_Fishes_New_Classification_Data

数据集概述

本数据集围绕硬骨鱼类的生命之树与新分类系统展开,包含基于1416个终端分类群(1410种硬骨鱼类、4种四足动物及2种软骨鱼类外类群)构建的系统发育树、相关序列数据及分类表格,为硬骨鱼类的系统发育研究与分类提供核心支撑。

文件详解

  • 文件名称:Concat_Three_Plus.nex
  • 文件格式:.nex
  • 字段映射介绍:包含用于系统发育分析的序列数据拼接文件,涉及21个分子标记(1个线粒体基因、20个核基因)的整合信息,支撑系统发育树构建的核心数据基础。
  • 文件名称:TABLE_S1.xlsx
  • 文件格式:.xlsx
  • 字段映射介绍:硬骨鱼类新分类系统相关的补充表格,可能涵盖分类单元对应关系、分类层级定义等结构化信息,辅助理解新分类体系的具体内容。
  • 文件名称:RAxMLThree_Plus_24_part.tre
  • 文件格式:.tre
  • 字段映射介绍:通过最大似然法构建的系统发育树文件,包含1416个终端分类群的系统发育关系,体现硬骨鱼类各主要类群的演化分支与节点支持度信息。

数据来源

论文“The tree of life and a new classification of bony fishes”

适用场景

  • 硬骨鱼类系统发育研究: 基于系统发育树与序列数据,分析硬骨鱼类各类群的演化关系、分支节点支持度及分类单元的系统发育位置。
  • 生物分类学应用: 参考新分类系统表格,更新硬骨鱼类的分类体系,明确传统鲈形目等类群的单系性定义。
  • 生物进化时间校准分析: 结合系统发育树与化石约束,开展硬骨鱼类演化时间线的校准与分析。
  • 比较生物学研究: 基于系统发育框架,探究硬骨鱼类多样性演化的驱动因素与演化规律。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 28.61 MiB
最后更新 2025年12月30日
创建于 2025年12月30日
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