数据集概述
本数据集为斑马鱼胚胎发育毒性筛选的形态特征自动评估实验数据,包含3个KNIME工作流文件和1个原始数据表格,用于实现图像旋转裁剪、心率分析及形态特征检测的自动化流程,辅助研究人员量化评估化合物对斑马鱼胚胎发育的毒性影响。
文件详解
- .knwf格式文件(共3个)
- 文件名称:Heart rate analysis_KNIME.zip.knwf、Rotate and crop image.knwf、FishInspector VAST_ToxSci.zip.knwf
- 文件格式:KNIME工作流文件
- 字段映射介绍:分别对应心率分析、图像旋转裁剪、FishInspector工具形态特征检测的自动化分析流程
- .xlsx格式文件(共1个)
- 文件名称:Raw_data_allchemicals.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含所有检测化合物(甲氨蝶呤、地塞米松、托吡酯、氯雷他定、格列本脲)的原始实验数据
适用场景
- 毒理学化合物筛选: 用于评估不同化合物对斑马鱼胚胎发育的毒性及形态影响
- 发育生物学研究: 分析胚胎发育过程中形态特征的变化规律
- 图像分析自动化应用: 验证FishInspector工具在生物图像形态特征检测中的准确性
- 实验流程标准化: 通过KNIME工作流实现斑马鱼胚胎毒性检测流程的自动化与标准化