数据集概述
本数据集基于淡水水库微生物群落的深度宏基因组测序，重建了7个放线菌基因组，涉及3个新的光异养浮游放线菌类群。数据包含原始测序、流式细胞术、16S比对及系统发育树等相关文件，可用于研究淡水放线菌的生态功能、基因组特征及与蓝细菌的生态关联，共7个文件。
文件详解
- 说明文档（.txt）
- 文件名称：README_for_RAW_Actino_Amadorio_FISH.txt、README_for_Cytometry.txt、README_for_16S-alignments.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：分别对应淡水放线菌FISH原始数据、流式细胞术数据、16S比对数据的说明文档，包含数据背景、实验方法及文件内容描述
- 压缩文件（.gz）
- 文件名称：phylogenetic-trees.gz、16S-alignments.gz
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：系统发育树压缩文件、16S序列比对结果压缩文件，包含放线菌基因组的系统发育分析数据及16S rRNA基因比对数据
- 表格文件（.xlsx）
- 文件名称：RAW_Actino_Amadorio_FISH.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：淡水放线菌FISH实验的原始数据表格，记录放线菌的荧光原位杂交检测结果
- 压缩文件（.zip）
- 文件名称：Cytometry.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：流式细胞术数据压缩包，包含淡水微生物群落的流式细胞检测原始输出文件
数据来源
论文“Key roles for freshwater Actinobacteria revealed by deep metagenomic sequencing”
适用场景
- 淡水微生物生态学研究：分析淡水放线菌的群落结构、基因组特征及生态功能
- 宏基因组学技术应用：验证深度宏基因组测序在难培养微生物基因组重建中的有效性
- 生态关联分析：探究淡水放线菌与蓝细菌的丰度关联及生态互作机制
- 环境监测：评估淡水放线菌作为生态灾难预警指示生物的潜力
- 生物地球化学循环研究：分析淡水放线菌对植物碎屑（如木质素衍生物）的降解能力及在碳循环中的作用
