数据集概述
本数据集为鹰嘴豆开花时间相关基因的表达数据,源自Ridge et al.(2017)论文Figure 5的数字化提取,是Gursky等(2018)研究的补充数据。覆盖FTa1、FTa2等10个基因,包含CDC Frontier和ICCV 96029两个品种在长日照(LD)、短日照(SD)条件下的表达量,以压缩包形式存储。
文件详解
- 压缩包文件
- 文件名称:data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含多个CSV文件,每个文件命名规则为__.csv;单个CSV文件含3个字段:time(播种后天数)、relative transcription level(相对转录水平,单位%ACTIN)、standard error(标准误差)
数据来源
论文“Dynamical Modeling of the Core Gene Network Controlling Flowering Suggests Cumulative Activation from the FLOWERING LOCUS T Gene Homologs in Chickpea”
适用场景
- 鹰嘴豆开花调控机制研究: 分析FT家族及AP1、FD等基因在不同日照条件下的表达模式,探究开花时间调控网络
- 作物品种改良: 对比CDC Frontier与ICCV 96029品种的基因表达差异,为鹰嘴豆早熟/晚熟品种选育提供数据支撑
- 光周期响应机制分析: 研究长日照、短日照条件对鹰嘴豆开花基因表达的影响
- 基因表达动力学建模: 基于时间序列表达数据构建开花基因网络的动态模型,验证FLOWERING LOCUS T同源基因的累积激活效应