数据集概述
本数据集围绕果实分解对植物微生物组组装的影响展开，通过扩增子测序分析番茄和辣椒植株在有无果实处理下的土壤、根际和叶际微生物群落，同时记录发芽率、植株生长指标及土壤理化性质。数据验证了果实分解对微生物多样性、群落组成及功能的调控作用，为果实除种子传播外的微生物组装功能提供证据。
文件详解
- 元数据文件
- 文件名称：metadata_chilli.txt、metadata_tomato.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含样本ID、组织类型（土壤等）、处理方式（果实处理/对照）、时间等实验设计信息
- 测序结果文件
- 文件名称：feature-table_tomato.biom、feature-table_chilli.biom
- 文件格式：BIOM
- 字段映射介绍：番茄和辣椒样本的微生物特征表，记录各分类单元的丰度信息
- 生长指标文件
- 文件名称：germination_rate.xlsx、germination_rate_tomato.xlsx、shoot_root_length_tomato.xlsx、shoot_root_length.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录植株发芽率、根长、 shoot长度等生长表型数据
- 土壤分析文件
- 文件名称：SoilAnalysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含土壤有机碳、硫、镁、钾等理化性质检测结果
- 代码与中间文件
- 文件名称：Fruit_decomposition_code.Rmd、william.rds、chilli.ps.clean.rds
- 文件格式：RMD、RDS
- 字段映射介绍：数据分析代码及微生物群落分析的中间结果文件
适用场景
- 植物微生物组研究: 分析果实分解对土壤、根际、叶际微生物群落结构与多样性的影响
- 土壤生态学研究: 探究果实分解对土壤理化性质（有机碳、养分元素）的调控作用
- 植物发育生物学研究: 研究果实分解对植物发芽率、幼苗生长等表型的影响机制
- 微生物功能预测: 基于微生物群落数据预测果实分解驱动的功能基因变化
- 农业生态应用: 为果实残留物管理、作物健康调控提供微生物组层面的理论依据
