复合叶趋同演化的遗传基础数据集

数据集概述

本数据集聚焦复合叶趋同演化的遗传基础研究,包含414种植物的转录因子基因家族列表、KNOX基因家族蛋白序列及亚类分类、基因复制模式,以及生长形式、生命周期等8项关键植物性状数据,同时提供系统发育树和分析代码,为相关研究提供全面数据支持。

文件详解

  • 压缩包文件: Leaf_Complexity_Convergence.zip,格式为ZIP压缩包,包含以下目录:
  • all_TF_family: 414种研究植物中所有转录因子基因家族的基因列表
  • KNOX_pep: 所有研究物种中KNOX基因家族的蛋白质序列
  • other_traits: 8项关键植物性状数据(生长形式、生命周期、叶习性、种子脱水行为、性别系统、传粉模式、花对称性、攀援能力)
  • duplication_modes: 414种植物中KNOX基因家族的基因复制模式
  • threeSubClasses: 414种植物中KNOX三个亚类(KNOXI、KNOXII、KNOXM)的基因列表
  • plant_megatree: GBOTB系统发育树(含79,881种种子植物),用于物种树构建
  • code.R: 研究中使用的R代码文件

适用场景

  • 植物遗传学研究:分析KNOX基因家族在复合叶趋同演化中的遗传机制
  • 进化生物学研究:探究植物性状(如叶习性、传粉模式)与基因复制模式的关联
  • 系统发育分析:利用植物系统发育树开展物种演化关系研究
  • 生物信息学应用:复现或扩展基于转录因子基因家族的分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.38 MiB
最后更新 2025年11月30日
创建于 2025年11月30日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。