数据集概述
本数据集围绕番茄果实成熟的转录调控机制展开,通过转录组分析和染色质免疫沉淀芯片技术(ChIP-chip),识别了番茄FUL1、FUL2两个MADS-box蛋白的直接靶基因,揭示其与RIN等蛋白协同或独立调控果实成熟的分子机制,包含六个补充数据文件。
文件详解
- 补充数据集文件
- 文件名称:tpc119453_Supplemental Data Set 1.xlsx、tpc119453_Supplemental Data Set 2.xlsx、tpc119453_Supplemental Data Set 3.xlsx、tpc119453_Supplemental Data Set 4.xlsx、tpc119453_Supplemental Data Set 5.xlsx、tpc119453_Supplemental Data Set 6.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含FUL1/FUL2抑制果实的转录组分析结果、ChIP-chip靶向番茄基因启动子的结合区域数据、FUL1/FUL2直接靶基因列表(含RIN靶基因与非靶基因)、靶基因功能分类信息及蛋白互作相关数据
数据来源
论文“Transcriptional regulation of fruit ripening by tomato FRUITFULL homologs and associated MADS-box proteins”
适用场景
- 植物分子生物学研究: 分析番茄果实成熟过程中MADS-box蛋白的转录调控网络
- 果实成熟机制解析: 探究FUL1/FUL2与RIN等蛋白协同调控果实成熟的分子机制
- 靶基因功能验证: 基于ChIP-chip和转录组数据筛选并验证果实成熟相关的关键靶基因
- 植物转录调控网络构建: 整合多组学数据构建番茄果实成熟的转录调控模型