数据集概述
本数据集围绕真菌根内生菌对植物的影响展开,聚焦内生菌与植物物种特异性互作及植物生长阶段的依赖性。包含从欧洲6种植物(3种扩域种、3种本地近缘种)中分离的34株内生菌的培养、鉴定及功能测试数据,涉及种子萌发、幼苗及成株生长等阶段的影响结果,总计7个文件。
文件详解
- Readme.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供所有文件的附加信息概述,帮助理解数据集结构与内容。
- germination_diff.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录内生菌接种种子与未接种种子的萌发差异原始数据,包含ID、culture(菌株)、treatment(处理)、genus(属)、test_plant(测试植物)、survival(存活率)、pdiff11(萌发差异)等字段。
- Endophytes_ITS_alignment.fst
- 文件格式:FST
- 字段映射介绍:30株真菌菌株的ITS区域序列比对数据(不包含18s_only中的菌株)。
- seedling_biomass_increase_diff.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录内生菌接种幼苗与未接种幼苗的生物量增长差异数据。
- plantBiomass_diff.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录内生菌对成株植物生物量影响的差异数据。
- 18s_only
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:18S rRNA基因序列比对数据,涉及无法测序ITS基因的菌株(16、23、30号培养物)。
- all_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:整合所有实验数据的表格文件,包含内生菌鉴定、各生长阶段影响等综合信息。
适用场景
- 植物微生物互作机制研究: 分析真菌根内生菌与不同植物物种(扩域种/本地种)的特异性互作模式。
- 植物生长阶段依赖性研究: 探究内生菌对种子萌发、幼苗生长、成株发育等不同阶段的影响差异。
- 内生菌功能鉴定: 基于菌株分类信息与植物表型数据,挖掘未明确功能内生菌的潜在作用。
- 扩域植物生态适应性分析: 研究内生菌对植物扩域过程中生长表现的影响,为植物分布动态提供依据。