数据集概述
本数据集为研究真菌相关群落宿主特异性的分子方法研究数据,包含312个真菌子实体样本的群落数据及分析脚本。数据基于新型DNA提取与PCR扩增方法,通过元条形码技术分析真菌宿主与关联生物群落的关系,验证宿主特异性是否为真菌相关群落的主要特征。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据采集、处理方法及文件结构等背景信息。
- Analytical scripts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:分析脚本压缩包,包含用于数据处理和统计分析的代码文件。
- 16s_taxonomy.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:16S rRNA基因分类数据,包含OTU编号、门、纲、目、科、属及分类单元名称等字段。
- community_rawdata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:群落原始数据,记录真菌子实体样本的关联生物群落组成信息。
- co1_taxonomy.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:CO1基因分类数据,包含昆虫纲、目、科、种等分类信息。
- its_taxonomy.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:ITS基因分类数据,包含真菌相关的分类学信息(具体字段未完全展示)。
数据来源
论文“Finding flies in the mushroom soup: host specificity of fungus-associated communities revisited with a novel molecular method”
适用场景
- 真菌相关群落结构分析: 研究不同真菌宿主物种的关联生物群落组成及多样性。
- 宿主特异性验证: 分析真菌宿主与关联生物之间的宿主特异性程度。
- 分子生态学方法应用: 评估新型DNA提取与PCR扩增方法在真菌相关群落研究中的效果。
- 生物多样性研究: 基于元条形码数据探索真菌子实体作为资源对其他生物类群的支持作用。
- 生态相互作用网络分析: 构建真菌宿主与关联生物的相互作用网络,分析群落动态。