腹足类水通道蛋白系统发育分类Fasta比对数据集

数据集概述

本数据集为《腹足类水通道蛋白的系统发育分类》论文分析的氨基酸序列Fasta比对文件,包含多种来源的序列标识,如GenBank登录号、DDBJ/EMBL登录号、部分组装的contig编号等,为腹足类水通道蛋白的系统发育研究提供序列比对数据支持。

文件详解

  • 文件名称: Aligned_Aquaporins.fas
  • 文件格式: Fasta (.fas)
  • 序列标识说明:
  • 多数序列以GenBank登录号标识
  • DDBJ或EMBL来源序列标注"accession from"
  • Nerita、Georissa、Pleuropoma属序列以论文提及的部分组装contig编号标识,对应GenBank登录号MF380517-MF380527、MF510930-MF510933
  • 太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)序列以CGI和基因座标签标识
  • 人类水通道蛋白序列以水通道蛋白类型+GenBank登录号标识
  • 以PC开头的序列来自Sun等2012年发表的福寿螺(Pomacea canaliculata)转录组数据

适用场景

  • 分子系统发育研究: 用于腹足类水通道蛋白家族的系统发育树构建与分类分析
  • 比较基因组学分析: 对比不同腹足类物种及人类水通道蛋白的氨基酸序列特征
  • 进化生物学研究: 探究腹足类水通道蛋白的进化起源与功能分化
  • 生物信息学教学: 作为Fasta格式序列比对文件的实例,用于序列分析工具操作教学
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.02 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。