g_permute_排列约化相空间密度压缩数据集

数据集概述

该数据集包含一个名为g_permute的程序，用于通过排列约化方法进行相空间密度压缩，以解决从分子动力学模拟轨迹中估算溶剂分子熵的问题，适用于研究生物分子过程中的熵变计算。

文件详解

• 文件名称: g_permute Permutation-reduced phase space density compaction/aecj_v1_0.tar.gz
• 文件格式: .gz（压缩包）
• 文件内容: 包含CPC程序库中的g_permute程序文件，用于处理分子动力学模拟轨迹数据，实现排列约化的相空间密度压缩功能。

数据来源

Queen's University Belfast CPC Program Library (1969-2018)

适用场景

• 生物分子模拟研究: 用于计算蛋白质溶剂化层的熵值，分析生物分子过程中的自由能变化
• 分子动力学数据分析: 处理溶剂分子的扩散运动轨迹数据，辅助熵估算相关的算法开发
• 计算生物学研究: 支持基于分子动力学模拟的生物分子热力学性质研究