数据集概述
本数据集为澳大利亚东南部淡水黑鱼(Gadopsis属)隐存生物多样性的多基因分子评估数据,包含核基因(51个同工酶位点、2个S7内含子)和母系标记(cytb)的分子数据,用于分析物种边界及遗传亚结构,识别出至少6个候选物种,助力淡水生物分类、保护与管理研究。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:gad.cytb.with.outs.final.nex、gad_cytb.s7.concat.dryad.sub.nex、gads7.with.outs.nex
- 文件格式:.nex
- 字段映射介绍:包含淡水黑鱼cytb基因、cytb与S7内含子串联、S7内含子的分子序列数据,用于物种边界及遗传结构分析
- 文档文件
- 文件名称:README_for_gad.relax.long.txt、README_for_gad_cytb.s7.concat.dryad.sub.txt
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:说明数据样本编号对应关系(如GB1对应67_Taggerty_1等)及数据相关背景信息
- 配置文件
- 文件名称:garli.bs.conf、garli.nobs.conf
- 文件格式:.conf
- 字段映射介绍:可能为分子进化分析工具GARLI的配置文件,用于控制系统发育分析参数
- 元数据文件
- 文件名称:gad.relax.long.xml
- 文件格式:.xml
- 字段映射介绍:数据集相关的元数据信息
数据来源
论文“A multigene molecular assessment of cryptic biodiversity in the iconic freshwater blackfishes (Teleostei: Percichthyidae: Gadopsis) of south-eastern Australia”
适用场景
- 淡水鱼类分类学研究:利用多基因分子数据明确Gadopsis属物种边界,识别隐存物种
- 生物多样性保护规划:基于遗传亚结构分析结果,为澳大利亚东南部淡水黑鱼制定针对性保护策略
- 分子系统发育分析:通过核基因与母系标记数据,探究淡水黑鱼的系统发育关系及地理分布格局
- 淡水生态管理:结合隐存生物多样性评估结果,优化高度受干扰区域的淡水生物资源管理方案