数据集概述
本数据集为南半球温带淡水鱼类优势类群Galaxiidae的迁徙状态与多样化率关系研究数据，包含分子系统发育重建结果、状态依赖的物种形成灭绝模型分析数据及相关代码文件，覆盖超95%现存谱系，用于量化迁徙对物种形成、灭绝及多样化率的影响。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称：SpecExtDivRates_HiSSE.csv、galstates_GeoHiSSE.csv、galstates_hisse.csv、SpecExtDivRates_GeoHiSSE.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含物种迁徙状态（Diadromous/非迁徙）、物种形成率（aSpeciation）、灭绝率、多样化率等模型输出参数，以及物种分布范围（Range）、分类单元信息等
- 文件名称：Galaxioid_Diversification_Beast.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录分子系统发育树构建的时间戳及处理信息
- 文件名称：Galaxioid_Diversification.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：系统发育分析工具BEAST的配置文件，包含数据输入、模型参数设置等信息
- 代码文件
- 文件名称：PlotFunction4HiSSE_PIES.R、galaxiids_HiSSE.R、galaxiids_GeoHiSSE.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于运行HiSSE/GeoHiSSE状态依赖多样化模型、处理数据及可视化结果的脚本代码
数据来源
论文“Does migration promote or inhibit diversification? A case study involving the dominant radiation of temperate Southern Hemisphere freshwater fishes”
适用场景
- 生物多样性研究：分析南半球淡水鱼类迁徙行为对物种多样化率的影响机制
- 进化生物学分析：利用状态依赖的物种形成灭绝模型，研究迁徙状态与物种形成、灭绝率的关系
- 系统发育建模：基于分子系统发育数据，验证中间扩散模型在淡水鱼类进化中的适用性
- 生物地理学研究：探索非迁徙Galaxiidae鱼类的异域物种形成或局部适应过程
- 生态数据建模：量化物种扩散能力与研究系统空间背景对多样化率的交互作用
