数据集概述
本数据集为肝内胆汁淤积小鼠模型的转录组学分析数据，围绕法尼醇X受体（FXR）在胆汁淤积发病机制中的作用展开。通过对α-萘基异硫氰酸酯（ANIT）诱导的胆汁淤积小鼠模型，分别采用奥贝胆酸（OCA）单独处理或与FXR拮抗剂GP7联合处理，利用RNAseq技术获取肝内基因表达数据，为研究FXR调控机制及药物干预效果提供支持。
文件详解
数据集按实验分组划分为4个目录，包含18个相同格式的文件，具体说明如下：
- 未处理小鼠组（Not treated mice/）：
- 文件示例：IonCode_NT1.chp、IonCode_NT2.chp、IonCode_NT3.chp、IonCode_NT4.chp
- 文件格式：.chp
- 内容说明：未接受任何处理的小鼠肝组织RNAseq数据文件
- α-萘基异硫氰酸酯（ANIT）处理组（α-naphthylisothiocyanate (ANIT) Treated mice/）：
- 文件示例：IonCode_ANIT1.chp、IonCode_ANIT2.chp、IonCode_ANIT3.chp、IonCode_ANIT4.chp
- 文件格式：.chp
- 内容说明：ANIT诱导胆汁淤积模型小鼠的肝组织RNAseq数据文件
- ANIT+奥贝胆酸（OCA）处理组（α-naphthylisothiocyanate (ANIT) + Obeticholic Acid Treated mice/）：
- 文件示例：ANIT+OCA 1.chp、ANIT + OCA 2.chp、ANIT + OCA 3.chp、ANIT+ OCA 4.chp、ANIT + OCA 5.chp
- 文件格式：.chp
- 内容说明：ANIT诱导后使用OCA处理的小鼠肝组织RNAseq数据文件
- ANIT+OCA+GP7联合处理组（α-naphthylisothiocyanate (ANIT) + Obeticholic Acid + GP7 Treated mice/）：
- 文件示例：ANIT+OCA+GP7 1.chp、ANIT+OCA+GP7 2.chp、ANIT+OCA+GP7 3.chp、ANIT+OCA+GP7 4.chp、ANIT+OCA+GP7 5.chp
- 文件格式：.chp
- 内容说明：ANIT诱导后使用OCA与GP7联合处理的小鼠肝组织RNAseq数据文件
适用场景
- 分子生物学研究：分析FXR信号通路在胆汁淤积中的基因表达调控机制
- 药理学研究：评估OCA单独或与GP7联合干预对胆汁淤积小鼠肝内基因表达的影响
- 胆汁淤积发病机制研究：探究ANIT诱导胆汁淤积模型的肝内转录组变化特征
- 药物靶点筛选：基于基因表达数据挖掘FXR相关的潜在治疗靶点
