数据集概述
本数据集包含化石记录中祖先-后代种群序列的演化模型拟合数据,涵盖静态、随机游走、定向演化等简单模型及含突变、模式转换的复杂模型。通过似然法分析,揭示化石记录中静态的普遍性及复杂演化模型的适用性,还结合全球气候代理数据模拟性状对温度变化的适应性追踪,为古生物学演化模式研究提供支持。
文件详解
- 说明文件(README)
- 文件名称:README_for_paleoTS summary.txt、README_for_paleoTS files.txt、README_for_paleoTS references.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集背景、文件说明、引用信息等内容,解释数据来源、分析方法及使用说明。
- 摘要数据文件
- 文件名称:paleoTS summary.xlsx、paleoTS summary.csv
- 文件格式:XLSX、CSV
- 字段映射介绍:包含datafile(数据文件)、lineage(谱系)、num.samples(样本数)、taxon(分类群)、taxon.category(分类群类别)、trait.type(性状类型)、environment(环境)、reference(引用)等字段,记录演化序列的基本信息。
- 引用数据文件
- 文件名称:paleoTS references.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含References for Dataset 1(数据集1引用)、Source(来源)、Full reference(完整引用)等字段,记录相关文献引用信息。
- 原始数据压缩包
- 文件名称:paleoTS files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含原始性状数据文件,可用于重新运行论文中的分析。
- R数据文件
- 文件名称:paleoTS files.RData
- 文件格式:RData
- 字段映射介绍:包含用于R语言分析的数据集,可直接加载进行演化模型拟合等分析。
数据来源
Dryad数据平台
适用场景
- 古生物学演化模式研究: 分析化石记录中性状演化的静态、定向、随机等模式,探究不同演化模型的适用性。
- 复杂演化模型验证: 评估含突变、模式转换的复杂演化模型在化石序列中的拟合效果,揭示真实演化动态的复杂性。
- 环境变化与性状演化关系分析: 结合全球气候代理数据,模拟性状对温度变化的适应性追踪,研究环境变化下的性状演化响应。
- 古生物学数据模拟: 利用经验演化序列和气候数据,开展适应性性状演化的模拟研究,验证简单模型对古生物学结果的重现能力。
- 演化模型方法比较: 对比不同似然法分析对演化模式检测的敏感性,优化演化模型选择的分析方法。