数据集概述
本数据集包含甘蔗蟾蜍脾脏组织经LPS和皮质酮急性处理后的RNA测序补充转录组数据，用于分析急性应激对免疫基因表达的影响，含实验相关的代码、序列及结果文件。
文件详解
- 文档文件：
- READ ME.docx：DOCX格式，可能包含数据集使用说明或实验背景介绍
- 代码文件：
- Supplemental File 1. canetoad mastercode.sh：SH格式，主流程代码
- Supplemental File 5. EDGE R Treatments vs Controls.R：R格式，对照组与处理组差异分析代码
- Supplemental File 6. EDGE R LPS+Cort vs LPS.R：R格式，LPS+皮质酮组与LPS组差异分析代码
- Supplemental File 7. transcriptIDs2.sh：SH格式，转录本ID处理代码
- Supplemental File 8. transcriptEval.sh：SH格式，转录本评估代码
- 序列及结果文件：
- Supplemental File 2. Trinity.fasta：FASTA格式，转录组组装序列
- Supplemental File 3. blastp.outfmt6：OUTFMT6格式，蛋白质比对结果
- Supplemental File 4. Trinity.fasta.transdecoder.mRNA：MRNA格式，转录本解码后的mRNA序列
适用场景
- 分子生物学研究：分析急性应激对甘蔗蟾蜍免疫基因表达的调控机制
- 转录组数据分析：验证LPS和皮质酮处理下的差异表达基因
- 生物信息学方法应用：复现或扩展转录组组装、功能注释及差异分析流程
- 比较免疫学研究：探究两栖动物应激与免疫应答的分子关联
