数据集概述
该数据集包含五个基于R语言Hmsc构建的高山草地群落联合物种分布模型输出,包括一个含所有数据的“全局”模型,以及针对Skjellingahaugen、Gudmedalen、Låvisdalen、Ulvehaugen四个位点的模型,Omega值为物种共现估计。
文件详解
该数据集包含54个文件,按类型分类如下:
- CSV格式文件(27个)
- 示例文件:parameter_estimates_VP_R2T_Beta Skjellingahaugen .csv、parameter_estimates_Omega_Gudmedalen_subplot_mean.csv
- 内容:包含Beta参数估计、Omega物种共现估计(均值/后验值)、方差分解(VP)、R²值等模型输出数据,部分文件含物种名称列(如Ach_mil、Agr_cap等)
- XLSX格式文件(21个)
- 示例文件:parameter_estimates_Beta_ Ulvehaugen .xlsx、parameter_estimates_Omega_ global _ site .xlsx
- 内容:存储各模型(全局/位点)的Beta参数、Omega物种共现估计等结构化数据
- PDF格式文件(4个)
- 示例文件:model_fit_nfolds_2.pdf、MCMC_convergence.pdf、predictions.pdf
- 内容:模型拟合评估(交叉验证)、MCMC收敛性分析、预测结果等可视化文档
- TXT格式文件(2个)
- 示例文件:MCMC_convergence.txt、parameter_estimates.txt
- 内容:MCMC收敛统计量(如beta参数的分位数、均值)、参数估计文本摘要
适用场景
- 群落生态学研究:分析高山草地物种间的共现模式及驱动因素
- 模型方法验证:验证Hmsc联合物种分布模型在不同位点的适用性
- 生物多样性分析:探究环境因子对多物种群落结构的影响
- 生态预测应用:基于模型输出预测草地群落对环境变化的响应
- 统计方法研究:评估MCMC算法收敛性及模型拟合效果的方法学应用