数据集概述
本数据集包含与Gut Analysis Toolbox（GAT）配套的肠道免疫荧光图像，主要来源为小鼠和人类结肠、小肠组织，涵盖肠神经元、神经胶质细胞的多通道标记图像及钙成像视频，支持肠道神经系统的结构与功能分析。
文件详解
- 单通道/多通道免疫荧光图像（TIF格式）
- 示例文件：181107_ms_distal_colon_GFAP_Hu_40X.tif、ms_distal_colon_Hu_20X.tif等
- 字段映射：包含Hu（泛神经元标记）、GFAP（神经胶质标记）、ChAT（胆碱乙酰转移酶）、nNOS（神经元型一氧化氮合酶）等通道标记信息
- 多标记复用图像（ZIP压缩包）
- 示例文件：Multiplexing_H2202Desc_Layer 1_Ganglia1_Hu.zip
- 字段映射：包含14种标记（Hu、5HT、ChAT等）的分层染色图像，文件名含样本名、染色轮次、神经节编号及标记名
- 钙成像视频（TIF格式）
- 示例文件：calcium_imaging_mouse_distal_colon_25X.tif、mouse_GCamp_calcium_movement.tif
- 字段映射：包含时间序列帧（142-745帧），记录钙信号动态变化
- 特殊格式图像（CZI格式）
- 示例文件：ms_distal_colon_nNOS_Hu_10X.czi
- 字段映射：需通过Bio-Formats或aicspylibczi打开，包含DAPI、nNOS、Hu三通道标记
- 图像摘要文件（TXT格式）
- 示例文件：001_image_summary.txt
- 字段映射：记录数据集整体说明及文件清单
数据来源
Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research、Monash University、University of Melbourne、SPARC公共 repository
适用场景
- 肠道神经系统结构分析：利用多通道标记图像识别肠神经元、神经胶质细胞的分布与形态
- 钙信号功能研究：通过钙成像视频分析肠神经细胞的活性动态变化
- 医学影像工具验证：作为Gut Analysis Toolbox的配套数据，测试神经节分割、细胞计数等功能
- 肠道疾病机制研究：对比正常与病变肠道组织的免疫荧光标记差异，探索疾病相关的神经改变
- 多标记复用技术应用：基于分层染色图像开发肠道神经元亚型的自动化识别算法
