数据集概述
本数据集基于OECD 236指南，对斑马鱼胚胎暴露于甲状腺活性化合物（T3、6-PTU、MMI、IOP）后的基因表达进行研究，包含RNA测序后的质控报告、差异基因表达分析结果及功能富集分析结果，用于识别甲状腺相关基因表达模式，支持甲状腺干扰活性评估。
文件详解
- results.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含差异基因表达分析（DGEA）结果表，采用DESeq2工具，经apeglm方法校正log2倍变化值，结果表标注为"reslfs"
- multiQC.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：原始RNA-Seq reads处理及质量控制的MultiQC报告
- KEGG_GO.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含Cluster（处理组）、ID（通路/基因集ID）、Description（描述）、GeneRatio（基因比例）、BgRatio（背景比例）、pvalue（P值）、p.adjust（校正P值）、geneID（基因ID）、Count（基因数量）等功能富集分析（ORA）结果字段
数据来源
ArrayExpress数据库（登录号E-MTAB-14185、E-MTAB-14184、E-MTAB-14183、E-MTAB-9054）
适用场景
- 甲状腺干扰物毒理学评估: 分析斑马鱼胚胎暴露于甲状腺活性化合物后的基因表达变化，识别甲状腺干扰生物标志物
- 差异基因表达分析: 基于DESeq2结果表研究化合物对特定基因的调控作用
- 功能基因组学研究: 利用KEGG_GO.csv的富集分析结果，探究甲状腺干扰相关的生物学通路及基因功能
- 毒理学实验方法优化: 参考OECD 236指南下的斑马鱼胚胎暴露实验设计及数据分析流程
