数据集概述
本数据集为研究德州珊瑚蛇(Micrurus tener)线粒体单倍型空间排序的相关数据,包含核DNA与线粒体DNA分析文件、物种分布模型数据等8个文件,用于验证遗传冲浪、局部适应、异域分化等假设对该蛇类遗传变异空间分布的解释力,支持种群遗传学研究。
文件详解
- 压缩文件(Archive files)
- 文件名称:Partial_Mantel_matrices.zip、nucDNA_RADseq_STACKS_data_Micrurus.zip、mtDNA_BEAST_ebsp.zip、nucDNA_RAxML_SNP_analysis.zip、mtDNA_IMa2_analysis.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Mantel矩阵、核DNA RADseq数据、线粒体DNA BEAST分析、核DNA RAxML SNP分析、线粒体DNA IMa2分析等相关压缩数据
- 文本文件(Document files)
- 文件名称:Micrurus_input_psi_statistic_4027_SNPs.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含4027个SNP位点的psi统计量输入数据,以样本标识(如M448_TEN)和数值序列形式呈现
- 表格文件(Data files)
- 文件名称:SDM_tener-fulvius-localities.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:德州珊瑚蛇与相关物种的物种分布模型(SDM)采样点信息表
- 其他文件(Other files)
- 文件名称:mtDNA_concatenated_Mr_Bayes.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:用于Mr Bayes分析的线粒体DNA串联数据文件
适用场景
- 种群遗传学研究:分析德州珊瑚蛇线粒体与核DNA的遗传结构及空间分布模式
- 遗传冲浪验证:验证遗传冲浪对物种遗传变异空间排序的影响,对比局部适应、异域分化等假设
- 物种分布模型构建:利用SDM数据研究德州珊瑚蛇的分布特征与环境适应性
- 分子系统发育分析:通过线粒体与核DNA数据开展珊瑚蛇类群的系统发育关系研究