数据集概述
本数据集聚焦分布边缘的冷水性鱼类（Coregonus artedi）种群，探究基因组与环境因素对其恢复力的影响。通过Rapture测序分析基因组多样性、有害突变频率及主要组织相容性复合体单倍型多样性，并关联纬度、湖泊面积、温氧生境等空间与环境因子，揭示孤立种群的遗传动态，为生物多样性保护提供依据。
文件详解
- 数据文件（CSV格式）
- 文件名称：如Bear_nhd_13078811.csv、WhiteSand_nhd_13343830.csv、PresqueIsleDO.csv等（共110个）
- 字段映射介绍：包含时间（time）、短波辐射（ShortWave）、长波辐射（LongWave）、气温（AirTemp）、相对湿度（RelHum）、风速（WindSpeed）、降雨（Rain）、降雪（Snow）、溶解氧（DO）等环境监测数据，及湖泊水文地理信息
- 模型配置文件（NML格式）
- 文件名称：如Sugar_aed2_zoop_pars.nml、Pike_glm2.nml、Howard_phyto.nml等（共203个）
- 内容说明：存储生态模型（如GLM、AED2）的参数配置，涉及浮游动物、浮游植物、水温等模拟参数
- 科学数据文件（MAT格式）
- 文件名称：如ElkhartTemp.mat、WhiteSandLakeTemp.mat、PresqueIsleDO.mat等（共58个）
- 内容说明：存储湖泊温度、溶解氧等环境数据的矩阵文件
- 代码文件（M格式）
- 文件名称：如WhiteSand_getoxydata.m、Plum_getoxydata.m等（共30个）
- 内容说明：用于提取和处理温氧生境数据的MATLAB脚本
- 文档文件
- 文件名称：README-python_scripts.txt（TXT格式）、README-GLMsimulations.docx（DOCX格式）
- 内容说明：包含Python脚本使用指南、GLM模拟说明等文档
数据来源
论文“Genomic and environmental influences on resilience in a cold‐water fish near the edge of its range”
适用场景
- 冷水性鱼类保护遗传学研究：分析孤立种群的基因组多样性、有害突变及适应性遗传变异，指导濒危种群保护策略制定
- 环境因子与种群遗传关联分析：探究纬度、湖泊面积、温氧生境等因素对鱼类种群遗传结构的影响
- 生态模型参数优化：利用模型配置文件和环境数据，优化冷水性鱼类生境模拟模型的参数设置
- 气候变化对水生生物影响研究：结合温度、溶解氧等长期监测数据，评估气候变化对边缘种群恢复力的潜在影响
