Genomic_repeat_abundances_phylogenetic_signal_系统发育分析数据

数据集概述

本数据集围绕基因组重复序列丰度的系统发育信号展开,包含3个附录文件。通过比较基于图的下一代测序读长聚类方法,估计不同类别基因组重复序列的丰度,并将其作为连续变化特征推断系统发育树。数据适用于6个案例(5种被子植物、1种昆虫)的系统发育分析,支持种间及属间关系研究。

文件详解

  • 文件名称:Online Appendix 1.docx
  • 文件格式:docx
  • 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含基因组重复序列聚类及丰度估计的方法细节或基础数据
  • 文件名称:Online Appendix 2.docx
  • 文件格式:docx
  • 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含系统发育树构建的参数设置、分析流程或中间结果数据
  • 文件名称:Online Appendix 3.docx
  • 文件格式:docx
  • 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含6个案例(5种被子植物、1种昆虫)的重复序列丰度数据、系统发育分析结果或验证数据

数据来源

论文“Genomic repeat abundances contain phylogenetic signal”

适用场景

  • 系统发育关系推断: 利用基因组重复序列丰度数据构建种间及属间系统发育树,验证与传统标记分析结果的一致性
  • 基因组进化比较研究: 分析不同物种基因组重复序列的丰度差异,探究基因组进化规律
  • 低分化类群系统发育分析: 为标准系统发育标记遗传分化小的类群提供替代分析方法
  • 基因组重复序列功能研究: 结合丰度数据与系统发育关系,探索重复序列在基因组进化中的作用机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.37 MiB
最后更新 2025年12月29日
创建于 2025年12月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。