数据集概述
本数据集围绕基因组重复序列丰度的系统发育信号展开,包含3个附录文件。通过比较基于图的下一代测序读长聚类方法,估计不同类别基因组重复序列的丰度,并将其作为连续变化特征推断系统发育树。数据适用于6个案例(5种被子植物、1种昆虫)的系统发育分析,支持种间及属间关系研究。
文件详解
- 文件名称:Online Appendix 1.docx
- 文件格式:docx
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含基因组重复序列聚类及丰度估计的方法细节或基础数据
- 文件名称:Online Appendix 2.docx
- 文件格式:docx
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含系统发育树构建的参数设置、分析流程或中间结果数据
- 文件名称:Online Appendix 3.docx
- 文件格式:docx
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含6个案例(5种被子植物、1种昆虫)的重复序列丰度数据、系统发育分析结果或验证数据
数据来源
论文“Genomic repeat abundances contain phylogenetic signal”
适用场景
- 系统发育关系推断: 利用基因组重复序列丰度数据构建种间及属间系统发育树,验证与传统标记分析结果的一致性
- 基因组进化比较研究: 分析不同物种基因组重复序列的丰度差异,探究基因组进化规律
- 低分化类群系统发育分析: 为标准系统发育标记遗传分化小的类群提供替代分析方法
- 基因组重复序列功能研究: 结合丰度数据与系统发育关系,探索重复序列在基因组进化中的作用机制