数据集概述
本数据集包含HapSTR基因座分型及相位测定的相关数据,HapSTR结合微卫星(STR)与侧翼单核苷酸多态性(SNP)信息,可提升人口参数估计能力。数据记录了从杂合个体PCR产物直接测序电泳图中推断HapSTR等位基因、侧翼单倍型及相位的方法,无需克隆或丙烯酰胺凝胶电泳分离等位基因,共含2个文件。
文件详解
- README_for_Genotyping_HapSTRs.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明Genotyping_HapSTRs.zip压缩包的关联手稿信息,及解压后生成的文件内容,包括Indigo38、Indigo40、Indigo41的正反向电泳图文件夹,HapSTR_examples.SPF示例文件等。
- Genotyping_HapSTRs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,包含与手稿相关的原始数据,解压后生成六个含电泳图的文件夹及HapSTR分型方法示例文件。
适用场景
- 基因分型方法研究:用于分析HapSTR基因座分型及相位测定的直接测序方法有效性。
- 人口遗传学研究:利用HapSTR数据提升人口参数(如种群结构、迁移率)估计的准确性。
- 分子生态学资源开发:为分子生态学研究提供高效的基因分型技术参考。
- 基因数据处理优化:探索无需克隆或凝胶电泳的低成本、快速基因分型流程。