数据集概述
本数据集围绕大熊猫放归保护项目,分析圈养、野化训练(含放归与未放归个体)、野化训练母熊猫、放归后追踪个体(张祥)及野生大熊猫的肠道菌群差异。通过16S rRNA基因V4区测序数据,探究肠道菌群在大熊猫放归适应过程中的变化及关键有益菌作用,包含元数据表格与分析代码压缩包两类文件。
文件详解
- 文件名称:Table_S1_metadata_information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含大熊猫样本的元数据信息,推测涵盖样本类型(圈养/野化训练/野生/放归后)、个体编号、年龄、放归状态、采样时间等关联信息,支撑肠道菌群数据的分组与分析。
- 文件名称:R_code_and_QIIME2.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含R语言分析代码及QIIME2分析流程文件,用于肠道菌群测序数据的处理、统计分析及可视化,支持重现研究中的菌群结构比较、差异菌筛选等核心分析步骤。
适用场景
- 大熊猫放归适应性研究: 分析放归个体肠道菌群向野生种群的转变过程,评估菌群对放归成功的潜在影响。
- 濒危动物肠道微生物组研究: 比较圈养、野化训练与野生大熊猫的肠道菌群结构差异,探究人工环境对菌群的塑造作用。
- 野生动物保护策略优化: 基于关键有益菌(如Roseburia、Coprococcus等)的筛选结果,为大熊猫野化训练中的肠道菌群调控提供参考。
- 微生物组数据分析方法重现: 通过R代码与QIIME2流程,复现肠道菌群测序数据的生物信息学分析过程,支持相关领域研究方法借鉴。