数据集概述
该数据集包含Gli1杂合与纯合突变体小鼠气管在未损伤及SO₂损伤后12小时、24小时的RNAseq FPKM数据，以及筛选Gli1相关、SO₂损伤诱导/抑制的前300个基因的分析步骤，为研究Gli1基因及SO₂损伤对气管基因表达的影响提供支持。
文件详解
该数据集包含一个目录及两个文件，具体说明如下：
- 目录：RNAseq FPKM, and analysis for mouse tracheal RNA from Gli1 heterozygous and homozygous mutants, uninjured and injured with SO2/
- 文件名称：Kong W RNAseq analysis.xlsx
- 文件格式：Excel表格（.xlsx）
- 内容说明：可能包含RNAseq FPKM数据及基因筛选分析结果，如不同实验条件下的基因表达量、前300个目标基因列表等
- 文件名称：Tuxedo mapping parameters.txt
- 文件格式：文本文档（.txt）
- 内容说明：记录Tuxedo比对参数，字段示例包括Reference genome（参考基因组：UCSC_mm10）、known genes Parameters（已知基因参数：-N 1 --read-gap-length 1等）
适用场景
- 分子生物学研究：分析Gli1基因对小鼠气管基因表达的调控作用
- 环境毒理学研究：探究SO₂损伤对气管转录组的影响及时间效应
- 基因功能分析：筛选SO₂损伤诱导或抑制的关键基因，挖掘潜在分子机制
- 生物信息学方法验证：基于Tuxedo比对参数复现或优化RNAseq数据分析流程
