数据集概述
本数据集为Gm364基因调控雌性生育力研究的补充数据，包含四个文件，对应论文中不同图表的实验结果。内容涉及生育力实验的随机分配表、基因表达FPKM值、DNA甲基化数据及差异表达基因/区域的Top20分析，支持研究Gm364通过AKT激活调控雌性生育力的机制。
文件详解
- Supplementary dataset 1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：WT交配雄鼠的随机分配表，用于图1I和1J的生育力实验，记录雄鼠在笼间的月度轮换安排，日期为推定值。
- Supplementary dataset 2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：对应图7A-C，包含3个WT或Gm364-KO重复样本的基因FPKM值、Log2-Ave值、Log2(Ave-KO/ave-WT)值；为避免0值计算错误，所有原始值加0.001，数据按Log2比值升序排列。
- Supplementary dataset 3.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：对应图7D和7E，含6个工作表：CPG/CHG/CHH-all info记录各基因启动子区域原始信息；CpG/CHG/CHH methyl value记录甲基化值、重复样本均值、Log2-Ave值、Log2(Ave-KO/ave-WT)值；原始值加0.001，数据按Log2比值升序排列。
- Supplementary dataset 4.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：对应图8A和8G，含2个工作表：RNA seq up & down top 20记录差异表达基因（DEGs）Top20上下调结果；RRBS up & down top 20记录差异甲基化区域（DMRs）Top20上下调结果。
数据来源
论文“Gm364 Coordinates MIB2/DLL3/Notch2 to Regulate Female Fertility through AKT Activation”
适用场景
- 雌性生育力基因调控机制研究：分析Gm364对MIB2/DLL3/Notch2通路及AKT激活的调控作用。
- 基因表达差异分析：利用FPKM值和Log2比值数据，研究Gm364-KO对基因表达的影响。
- DNA甲基化调控研究：通过甲基化值和差异甲基化区域数据，探究Gm364对表观遗传修饰的作用。
- 实验设计参考：借鉴生育力实验的雄鼠随机分配方案，优化动物实验设计。
- 差异基因/甲基化区域筛选：基于Top20上下调结果，快速定位关键调控基因和区域。
