数据集概述
本数据集为研究论文配套数据，包含通过病毒组挖掘发现的功能性无因子内部核糖体进入位点（IRES）样结构相关实验数据，涉及核糖体结合序列、慢病毒文库覆盖度、原始测序数据及SHAPE-MaP分析结果等，为相关分子机制研究提供数据支持。
文件详解
- 核糖体结合序列文件：
- Chapagain_et_al_Type_6_80S_binding_seq.csv：CSV格式，包含核糖体结合序列的编号、读数数量、覆盖碱基、覆盖率等字段，如rname（序列名）、numreads（读数）、covbases（覆盖碱基）等。
- 慢病毒文库覆盖度文件：
- 位于Chapagain_et_al_Type_6_lentiviral_library_coverage/目录下，如Lib2RubyTh.coverage.txt等TXT格式文件，包含文库序列的起始/终止位置、读数、覆盖度等信息，字段包括rname、startpos、endpos、numreads等。
- 原始测序数据文件：
- 位于Chapagain_et_al_Type_6_lenti_library_raw_fastq_seq/目录下，如Lib2Ruby0_S4_R1_001.fastq.gz等.gz压缩格式文件，为慢病毒文库的原始Fastq测序数据。
- SHAPE数据文件：
- 原始扩增子测序数据：位于SHAPE-data for Mendeley/Raw amplicon sequencing data/目录下，如T_U_2_S12_R1_001.fastq.gz等.gz格式文件，为扩增子测序原始数据。
- SHAPE-MaP分析结果：位于SHAPE-data for Mendeley/SHAPE-MaP data for non-DV1 RNA/目录下，包含TXT格式的谱图数据、PDF格式的结果图表、FA格式的校正序列等文件。
适用场景
- 分子生物学研究：分析无因子IRES样结构的功能机制及核糖体结合特性。
- 病毒基因组学研究：探究病毒组中功能性RNA结构的分布与作用。
- 测序数据分析：验证慢病毒文库构建及测序实验的可靠性与覆盖度。
- 结构生物学研究：结合SHAPE-MaP数据解析RNA分子的二级结构特征。
