数据集概述
本数据集包含鼠鱚目鱼类系统发育关系与分化时间研究的相关数据,基于九个核基因的DNA序列及已发表的形态学特征矩阵,通过贝叶斯系统发育分析等方法,探究鼠鱚目鱼类的系统发育与分化时间,涉及不同基因树的一致性、类群单系性及分化时间估计等内容。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_gonorynchALL.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供数据集相关说明,包含各文件内容概述等信息。
- 核基因序列比对文件(.nex格式,共11个)
- 文件名称:gonorynchSH3.nex、gonorynchENC.nex、gonorynchMYH.nex、gonorynchPTR.nex、gonorynchTBR.nex、gonorynchALL.nex、gonorynchPLAG.nex、gonorynchTOT.nex、gonorynchGlyt.nex等
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:gonorynchALL.nex为所有9个核基因的交错比对文件;gonorynchTOT.nex为所有9个核基因与形态学数据的交错比对文件;其余如gonorynchENC.nex为ENC1核基因比对文件,gonorynchGlyt.nex为Glyt核基因比对文件等,分别对应不同核基因的序列比对数据。
- XML元数据文件
- 文件名称:gonorynchTIPa.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含数据集相关元数据信息。
数据来源
论文“Phylogenetic relationships and timing of diversification in gonorynchiform fishes inferred using nuclear gene DNA sequences (Teleostei: Ostariophysi)”
适用场景
- 鱼类系统发育研究:用于分析鼠鱚目鱼类的系统发育关系,探究不同类群的亲缘关系。
- 生物进化时间估计:结合核基因序列与形态学数据,估计鼠鱚目鱼类的分化时间。
- 分子生物学数据分析:对核基因序列比对数据进行分析,研究基因树的一致性等。
- 鱼类分类学研究:为鼠鱚目鱼类的分类提供分子生物学方面的依据。