gonorynchiform_Based_鼠鱚目鱼类系统发育与分化时间研究数据

数据集概述

本数据集包含鼠鱚目鱼类系统发育关系与分化时间研究的相关数据,基于九个核基因的DNA序列及已发表的形态学特征矩阵,通过贝叶斯系统发育分析等方法,探究鼠鱚目鱼类的系统发育与分化时间,涉及不同基因树的一致性、类群单系性及分化时间估计等内容。

文件详解

  • README文件
  • 文件名称:README_for_gonorynchALL.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:提供数据集相关说明,包含各文件内容概述等信息。
  • 核基因序列比对文件(.nex格式,共11个)
  • 文件名称:gonorynchSH3.nex、gonorynchENC.nex、gonorynchMYH.nex、gonorynchPTR.nex、gonorynchTBR.nex、gonorynchALL.nex、gonorynchPLAG.nex、gonorynchTOT.nex、gonorynchGlyt.nex等
  • 文件格式:NEX
  • 字段映射介绍:gonorynchALL.nex为所有9个核基因的交错比对文件;gonorynchTOT.nex为所有9个核基因与形态学数据的交错比对文件;其余如gonorynchENC.nex为ENC1核基因比对文件,gonorynchGlyt.nex为Glyt核基因比对文件等,分别对应不同核基因的序列比对数据。
  • XML元数据文件
  • 文件名称:gonorynchTIPa.xml
  • 文件格式:XML
  • 字段映射介绍:包含数据集相关元数据信息。

数据来源

论文“Phylogenetic relationships and timing of diversification in gonorynchiform fishes inferred using nuclear gene DNA sequences (Teleostei: Ostariophysi)”

适用场景

  • 鱼类系统发育研究:用于分析鼠鱚目鱼类的系统发育关系,探究不同类群的亲缘关系。
  • 生物进化时间估计:结合核基因序列与形态学数据,估计鼠鱚目鱼类的分化时间。
  • 分子生物学数据分析:对核基因序列比对数据进行分析,研究基因树的一致性等。
  • 鱼类分类学研究:为鼠鱚目鱼类的分类提供分子生物学方面的依据。
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.73 MiB
最后更新 2026年1月20日
创建于 2026年1月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。