数据集概述
本数据集为水稻干旱适应进化系统生物学研究的处理后RNA表达计数数据，包含6个水稻品种（涵盖circus-aus、indica和japonica亚种）在湿润与干旱两种田间环境下的转录组数据，通过3'mRNA-seq技术检测叶和冠根的基因表达水平，涉及样本元数据与基因表达计数文件。
文件详解
- HMHTMBGX3_Sample_Metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含样本的实验设计信息，可能涵盖品种、田间处理（湿润/干旱）、组织类型（叶/冠根）、生物重复、采样时间等元数据
- HMHTMBGX3_Ensembl-1.0.37_UMIs.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含基因表达计数矩阵，第一列为GENE（基因标识），后续列对应不同样本的UMI（唯一分子标识符）计数，反映各基因在样本中的表达水平
数据来源
Groen et al.研究论文：Evolutionary systems biology reveals patterns of rice adaptation to drought-prone agro-ecosystems
适用场景
- 水稻干旱适应性基因表达分析：研究不同水稻亚种在干旱胁迫下的转录组变化，挖掘耐旱相关基因
- 农业生物技术研究：为水稻耐旱品种选育提供基因表达层面的分子依据
- 植物逆境生理学研究：分析干旱对水稻叶和冠根组织基因表达的差异影响
- 进化系统生物学研究：探究水稻适应干旱农业生态系统的转录组进化模式
