数据集概述
本数据集为补充表格S2,收录基于8个小鼠肾皮质样本中至少7个样本有映射读数的嗅觉受体(ORs)。样本含高脂饮食组(A-G)和对照组(I-M),包含mm10与mm9两种基因组版本的FPKM表达量,以及Olfr基因名、CUFFOR名,绿色标注的ORs为先前从肾脏RNA中鉴定并克隆的受体。
文件详解
- 文件名称:CUFFORs Table S2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含研究选取的嗅觉受体信息,具体字段含ORs的Olfr基因名、CUFFOR名(来源Ibarra-Soria X等研究)、基于mm10基因组的FPKM表达量、基于mm9基因组的FPKM表达量,绿色标注的ORs为先前从肾脏RNA中鉴定并克隆的受体。
数据来源
NCBI GEO数据库, accession number GSE117249
适用场景
- 嗅觉受体基因表达研究: 分析小鼠肾皮质中新型嗅觉受体的表达特征及组间差异。
- 饮食对基因表达影响分析: 对比高脂饮食组与对照组小鼠肾皮质嗅觉受体的表达水平变化。
- 基因组版本差异研究: 探究mm10与mm9两种基因组版本对嗅觉受体FPKM计算结果的影响。
- 肾脏嗅觉受体功能验证: 基于绿色标注的已克隆ORs,开展后续功能实验验证。