数据集概述
本数据集为雌性小鼠下丘脑弓状核（ARC）和内侧视前区（MPOA）在饱腹、泌乳等状态下的单细胞RNA测序数据，包含细胞注释、基因表达分析脚本及差异表达基因结果，支持研究下丘脑神经回路对摄食和育幼行为的调控机制。
文件详解
- 数据文件
- allmetadata.csv（CSV格式）：含CellID、orig.ident、nCount_RNA、nFeature_RNA、region、mouse、labels等细胞注释字段
- ARC.clustermarks.xlsx/MPOA.clustermarks.xlsx（XLSX格式）：记录ARC/MPOA区域神经元集群的细胞数量和标记基因
- 差异表达基因文件（如ARC.MFvMS.xlsx、MPOA.MSvVS.xlsx等，XLSX格式）：包含不同状态（饱腹/泌乳/禁食）下的基因表达差异结果
- 分析脚本
- LoadProcDEGs.R（R格式）：加载数据、预处理及差异表达基因分析脚本
- ARC-Campbell-Compare.R/MPOA-Zhuang-Compare.R（R格式）：与已发表数据集的集群比较脚本
- ContributionPCA.R（R格式）：计算神经元集群对主成分的贡献脚本
数据来源
Gene Expression Omnibus（GEO）数据库， accession code GSE295610；论文"A hypothalamic circuit that modulates feeding and parenting behaviors"（Alcantara et al., 2025, Nature）
适用场景
- 神经生物学研究：分析下丘脑ARC和MPOA区域在摄食、泌乳状态下的细胞类型及基因表达变化
- 行为调控机制研究：探究调控摄食和育幼行为的下丘脑神经回路分子基础
- 转录组数据分析：支持单细胞RNA测序数据的预处理、差异表达及集群比较分析
- 基因标记物筛选：识别特定神经元集群的分子标记物，助力神经细胞类型鉴定
