谷氨酸损伤ADSC_EVs预处理R28细胞的小分子RNA测序数据集

数据集概述

本数据集通过小分子RNA测序分析,对比谷氨酸损伤组(3样本)与ADSC-EVs预处理后谷氨酸损伤组(3样本)的R28细胞,旨在识别调控兴奋性毒性的关键微小RNA,包含测序数据、注释结果及差异表达分析文件。

文件详解

该数据集按功能目录分类,包含以下核心文件: - 质量控制文件(QCTable/目录): - QC.xlsx:质量控制统计数据 - EVs_1.length.txt等:序列长度分布数据 - EVs_2.length.distribution.pdf等:长度分布可视化图表 - 基因组比对文件(genome_mapping/目录): - genome.alignment.stat.xlsx:基因组比对统计数据 - 注释摘要文件(annotation_summary/目录): - EVs_1.all.piechart.pdf等:注释结果饼图 - EVs_2.annotation.length.all.pdf等:注释序列长度分布图表 - EVs_1.annotation.stat.xls等:注释统计表格 - 微小RNA注释文件(miRNA_annotation/目录): - EVs_1.mature.all.base.distribution.pdf等:成熟miRNA碱基分布图表 - 微小RNA表达文件(miRNA_expression/目录): - counts.xlsx:表达量计数数据 - box-TPM.pdf:TPM值箱线图 - heatmap-coefficient_matrix.pdf:相关性热图 - 差异表达分析文件(Glu-vs-EVs different_expressed_miRNA/目录): - Glu-vs-EVs-volcano-pval-0.05-FC-2.miRNA.png:差异表达火山图 - Glu-vs-EVs-heatmap-pval-0.05-FC-2.miRNA.pdf:差异表达热图 - Glu-vs-EVs-diff-pval-0.05-FC-2.miRNA.xls:差异表达miRNA列表 - 靶基因预测文件(target_predict_analysis/目录): - Glu-vs-EVs.target.result.xls:靶基因预测结果 - calcium pathyway result.xlsx:钙通路分析结果 - 重复元件注释文件(Repbase_annotation/目录): - EVs_1_repeat_element_distribution_total.png等:重复元件分布图表 - Rfam注释文件(Rfam_annotation/目录): - EVs_2.Rfam.stat.xls等:Rfam注释统计数据

适用场景

  • 神经生物学研究:分析ADSC-EVs对谷氨酸损伤R28细胞的保护机制
  • 微小RNA功能研究:识别调控兴奋性毒性的关键miRNA
  • 生物信息学分析:验证小分子RNA测序数据的分析流程
  • 药物开发研究:探索ADSC-EVs作为神经保护剂的潜在靶点
  • 细胞损伤机制研究:解析谷氨酸兴奋性毒性的分子调控网络
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.4 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
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